IS> PHP, насколько я понимаю (я в нём плохо разбираюсь), не разницы, как
IS> его запустили - как mod_perl или как fastcgi. А вот с перлом ситуация
разница есть даже в самой функциональности РНР, есть целый ряд функций mod_php
only, да и к примеру настройки РНР очень удобно в .htaccess пихать.
всякие url типа /file.php/aaa/bbb/ccc работать не будут, список думаю можно
продолжить.