У меня как раз такая ошибка появлялась, когда я сильно зажимал лимиты. Первый раз появилась, когда я неправильно настроил общий лимит на весь сервер, вместо лимита на каждого виртуального сервера. Второй раз появлялась когда именно были маленькие значения на лимит соединений с одого IP адреса. Просто бывают конторы, работающие через один прокси и пролучается что им 4 соединения например уже маловато будет!
Для того чтобы выяснить что именно не так - попробуй временно отключить тот или иной лимит и посмотреть как будет без него. Потом соответственно скорректировать значения!