Появляется только если включено кеширование дескрипторов и я пытаюсь
открыть странуцу, пока файл перезаписывается....
видимо, nginx пытается отдать данные по уже несуществующему в файле смещению. Отключайте кеш
дескрипторов для таких файлов или уменьшайте его таймауты и игнорируйте эти ошибки.