Да, но каков процент промышленных систем, построенных на подобных дистрибутивах? "Энтерпрайзом" правят redhat, suse и им подобные бинарные дистрибутивы. Скорость работы приложений часто ставится ниже приоритетом перед простотой управления/развертывания/обновления.
Топикстартеру: никто не мешает вам организовать свой собственный репозиторий с пакетами nginx, собранными с разными опциями. Будет вам и привычный порядок и все бенефиты сборки из исходников.
Пользователи gentoo/archlinux почти все приложения все собирают из исходников и
никакой помойки нет...
